Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD6P30203 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD6P30203 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD6P30203 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD6P30203 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD6P30203 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD6P30203 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD6P30203 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD6P30203 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD6P30203 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD6P30203 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD6P30203 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD6P30203 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD6P30203 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD6P30203 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD6P30203 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD6P30203 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD6P30203 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD6P30203 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD6P30203 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD6P30203 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD6P30203 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD6P30203 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD6P30203 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD6P30203 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD6P30203 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD6P30203 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD6P30203 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD6P30203 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD6P30203 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD6P30203 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD6P30203 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD6P30203 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD6P30203 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD6P30203 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD6P30203 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD6P30203 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD6P30203 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD6P30203 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD6P30203 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD6P30203 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD6P30203 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD6P30203 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD6P30203 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD6P30203 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD6P30203 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD6P30203 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD6P30203 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD6P30203 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD6P30203 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD6P30203 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD6P30203 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD6P30203 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD6P30203 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD6P30203 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD6P30203 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD6P30203 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD6P30203 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms