Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E2P29084 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E2P29084 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms