Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms