Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms