Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NMBRP28336 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NMBRP28336 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMBRP28336 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMBRP28336 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMBRP28336 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMBRP28336 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMBRP28336 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMBRP28336 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMBRP28336 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMBRP28336 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMBRP28336 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMBRP28336 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMBRP28336 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMBRP28336 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMBRP28336 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMBRP28336 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMBRP28336 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMBRP28336 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMBRP28336 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMBRP28336 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMBRP28336 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBRP28336 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBRP28336 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBRP28336 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBRP28336 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBRP28336 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBRP28336 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBRP28336 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBRP28336 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBRP28336 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBRP28336 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBRP28336 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMBRP28336 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMBRP28336 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMBRP28336 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NMBRP28336 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMBRP28336 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMBRP28336 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBRP28336 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBRP28336 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBRP28336 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBRP28336 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBRP28336 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBRP28336 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBRP28336 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBRP28336 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBRP28336 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBRP28336 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NMBRP28336 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NMBRP28336 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NMBRP28336 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMBRP28336 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMBRP28336 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMBRP28336 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMBRP28336 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMBRP28336 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMBRP28336 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMBRP28336 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMBRP28336 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMBRP28336 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMBRP28336 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMBRP28336 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMBRP28336 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMBRP28336 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMBRP28336 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMBRP28336 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMBRP28336 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMBRP28336 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMBRP28336 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMBRP28336 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMBRP28336 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMBRP28336 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMBRP28336 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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