Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCD3P28288 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCD3P28288 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCD3P28288 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCD3P28288 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCD3P28288 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCD3P28288 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCD3P28288 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCD3P28288 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCD3P28288 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCD3P28288 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABCD3P28288 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABCD3P28288 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms