Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4AP27815 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4AP27815 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms