Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HMGB2P26583 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms