Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMLP26374 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMLP26374 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMLP26374 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMLP26374 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMLP26374 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMLP26374 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMLP26374 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMLP26374 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMLP26374 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMLP26374 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMLP26374 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMLP26374 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMLP26374 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMLP26374 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMLP26374 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMLP26374 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMLP26374 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMLP26374 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMLP26374 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMLP26374 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMLP26374 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMLP26374 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMLP26374 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMLP26374 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMLP26374 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMLP26374 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMLP26374 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMLP26374 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMLP26374 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMLP26374 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMLP26374 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMLP26374 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMLP26374 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMLP26374 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMLP26374 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMLP26374 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMLP26374 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMLP26374 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMLP26374 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMLP26374 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMLP26374 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMLP26374 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMLP26374 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMLP26374 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMLP26374 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMLP26374 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMLP26374 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMLP26374 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMLP26374 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMLP26374 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMLP26374 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMLP26374 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMLP26374 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMLP26374 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMLP26374 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMLP26374 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMLP26374 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMLP26374 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMLP26374 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMLP26374 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMLP26374 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMLP26374 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMLP26374 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMLP26374 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMLP26374 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMLP26374 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMLP26374 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMLP26374 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMLP26374 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMLP26374 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHMLP26374 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHMLP26374 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms