Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms