Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPREP23469 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPREP23469 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPREP23469 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPREP23469 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPREP23469 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPREP23469 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPREP23469 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPREP23469 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPREP23469 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPREP23469 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPREP23469 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPREP23469 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPREP23469 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPREP23469 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPREP23469 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPREP23469 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPREP23469 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPREP23469 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPREP23469 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPREP23469 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPREP23469 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPREP23469 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPREP23469 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPREP23469 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPREP23469 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPREP23469 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPREP23469 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPREP23469 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPREP23469 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPREP23469 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPREP23469 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPREP23469 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPREP23469 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPREP23469 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPREP23469 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPREP23469 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPREP23469 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPREP23469 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPREP23469 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPREP23469 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPREP23469 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPREP23469 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPREP23469 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPREP23469 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPREP23469 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPREP23469 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPREP23469 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPREP23469 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPREP23469 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPREP23469 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPREP23469 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPREP23469 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPREP23469 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPREP23469 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPREP23469 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPREP23469 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPREP23469 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPREP23469 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPREP23469 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPREP23469 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPREP23469 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPREP23469 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPREP23469 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPREP23469 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPREP23469 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPREP23469 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPREP23469 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPREP23469 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPREP23469 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPREP23469 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPREP23469 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPREP23469 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPREP23469 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPREP23469 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPREP23469 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPREP23469 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPREP23469 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPREP23469 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPREP23469 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPREP23469 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPREP23469 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPREP23469 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPREP23469 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPREP23469 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPREP23469 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms