Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLDCP23378 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLDCP23378 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLDCP23378 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLDCP23378 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLDCP23378 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLDCP23378 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLDCP23378 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLDCP23378 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLDCP23378 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLDCP23378 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLDCP23378 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLDCP23378 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLDCP23378 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLDCP23378 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLDCP23378 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLDCP23378 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLDCP23378 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLDCP23378 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLDCP23378 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLDCP23378 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLDCP23378 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLDCP23378 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GLDCP23378 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLDCP23378 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLDCP23378 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLDCP23378 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLDCP23378 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLDCP23378 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLDCP23378 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLDCP23378 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLDCP23378 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLDCP23378 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLDCP23378 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLDCP23378 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GLDCP23378 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLDCP23378 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLDCP23378 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLDCP23378 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLDCP23378 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLDCP23378 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLDCP23378 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLDCP23378 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLDCP23378 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLDCP23378 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLDCP23378 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLDCP23378 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLDCP23378 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GLDCP23378 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLDCP23378 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLDCP23378 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLDCP23378 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLDCP23378 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLDCP23378 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLDCP23378 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLDCP23378 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLDCP23378 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GLDCP23378 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLDCP23378 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLDCP23378 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLDCP23378 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLDCP23378 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLDCP23378 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLDCP23378 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLDCP23378 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLDCP23378 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLDCP23378 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLDCP23378 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLDCP23378 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLDCP23378 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLDCP23378 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLDCP23378 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLDCP23378 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLDCP23378 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLDCP23378 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLDCP23378 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLDCP23378 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLDCP23378 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GLDCP23378 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLDCP23378 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLDCP23378 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLDCP23378 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLDCP23378 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLDCP23378 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLDCP23378 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLDCP23378 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLDCP23378 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms