Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTNP21246 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTNP21246 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTNP21246 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTNP21246 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTNP21246 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTNP21246 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTNP21246 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTNP21246 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTNP21246 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTNP21246 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTNP21246 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTNP21246 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTNP21246 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTNP21246 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTNP21246 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTNP21246 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTNP21246 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTNP21246 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTNP21246 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTNP21246 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTNP21246 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTNP21246 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTNP21246 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTNP21246 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTNP21246 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTNP21246 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTNP21246 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTNP21246 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTNP21246 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTNP21246 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTNP21246 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTNP21246 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTNP21246 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTNP21246 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTNP21246 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTNP21246 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTNP21246 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTNP21246 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTNP21246 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTNP21246 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms