Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC9A1P19634 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms