Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM21P19474 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms