Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2EP19388 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms