Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD58P19256 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD58P19256 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD58P19256 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD58P19256 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD58P19256 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD58P19256 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD58P19256 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD58P19256 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD58P19256 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD58P19256 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD58P19256 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD58P19256 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD58P19256 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD58P19256 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD58P19256 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD58P19256 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD58P19256 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD58P19256 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD58P19256 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD58P19256 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CD58P19256 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD58P19256 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD58P19256 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD58P19256 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD58P19256 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD58P19256 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD58P19256 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD58P19256 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD58P19256 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD58P19256 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD58P19256 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD58P19256 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD58P19256 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD58P19256 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD58P19256 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD58P19256 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD58P19256 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD58P19256 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD58P19256 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD58P19256 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD58P19256 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD58P19256 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD58P19256 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD58P19256 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD58P19256 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD58P19256 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD58P19256 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD58P19256 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD58P19256 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CD58P19256 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD58P19256 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD58P19256 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD58P19256 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD58P19256 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD58P19256 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD58P19256 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD58P19256 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD58P19256 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD58P19256 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CD58P19256 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD58P19256 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD58P19256 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD58P19256 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD58P19256 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD58P19256 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD58P19256 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD58P19256 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD58P19256 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD58P19256 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD58P19256 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD58P19256 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD58P19256 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD58P19256 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms