Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM1P18669 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms