Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL17P18621 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL17P18621 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL17P18621 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL17P18621 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL17P18621 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL17P18621 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL17P18621 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL17P18621 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL17P18621 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL17P18621 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL17P18621 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL17P18621 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL17P18621 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL17P18621 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL17P18621 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL17P18621 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL17P18621 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL17P18621 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL17P18621 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL17P18621 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL17P18621 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL17P18621 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL17P18621 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL17P18621 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL17P18621 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL17P18621 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL17P18621 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL17P18621 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL17P18621 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL17P18621 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL17P18621 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL17P18621 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL17P18621 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPL17P18621 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL17P18621 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL17P18621 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL17P18621 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL17P18621 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL17P18621 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL17P18621 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL17P18621 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL17P18621 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL17P18621 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL17P18621 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL17P18621 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL17P18621 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL17P18621 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL17P18621 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL17P18621 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL17P18621 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL17P18621 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL17P18621 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL17P18621 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL17P18621 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL17P18621 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL17P18621 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL17P18621 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL17P18621 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL17P18621 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL17P18621 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL17P18621 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL17P18621 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL17P18621 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL17P18621 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL17P18621 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL17P18621 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL17P18621 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL17P18621 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL17P18621 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL17P18621 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms