Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP1P17987 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP1P17987 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP1P17987 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP1P17987 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP1P17987 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP1P17987 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP1P17987 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP1P17987 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP1P17987 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP1P17987 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP1P17987 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP1P17987 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP1P17987 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP1P17987 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP1P17987 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCP1P17987 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCP1P17987 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCP1P17987 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCP1P17987 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCP1P17987 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCP1P17987 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCP1P17987 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP1P17987 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP1P17987 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP1P17987 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP1P17987 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP1P17987 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP1P17987 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP1P17987 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP1P17987 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP1P17987 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP1P17987 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP1P17987 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP1P17987 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP1P17987 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP1P17987 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP1P17987 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP1P17987 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP1P17987 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP1P17987 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP1P17987 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP1P17987 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP1P17987 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP1P17987 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP1P17987 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP1P17987 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP1P17987 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP1P17987 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP1P17987 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP1P17987 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP1P17987 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP1P17987 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP1P17987 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP1P17987 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP1P17987 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP1P17987 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP1P17987 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP1P17987 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP1P17987 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP1P17987 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCP1P17987 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCP1P17987 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TCP1P17987 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCP1P17987 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCP1P17987 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCP1P17987 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCP1P17987 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TCP1P17987 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCP1P17987 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCP1P17987 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCP1P17987 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCP1P17987 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCP1P17987 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCP1P17987 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCP1P17987 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCP1P17987 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCP1P17987 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCP1P17987 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCP1P17987 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCP1P17987 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCP1P17987 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCP1P17987 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCP1P17987 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCP1P17987 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCP1P17987 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCP1P17987 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCP1P17987 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCP1P17987 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCP1P17987 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCP1P17987 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCP1P17987 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCP1P17987 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCP1P17987 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCP1P17987 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCP1P17987 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCP1P17987 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCP1P17987 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCP1P17987 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCP1P17987 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms