Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPI1P17947 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPI1P17947 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPI1P17947 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPI1P17947 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPI1P17947 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPI1P17947 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPI1P17947 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPI1P17947 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPI1P17947 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPI1P17947 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPI1P17947 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPI1P17947 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPI1P17947 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPI1P17947 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPI1P17947 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPI1P17947 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPI1P17947 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPI1P17947 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPI1P17947 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPI1P17947 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPI1P17947 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPI1P17947 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPI1P17947 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPI1P17947 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPI1P17947 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPI1P17947 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPI1P17947 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPI1P17947 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPI1P17947 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPI1P17947 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPI1P17947 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPI1P17947 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPI1P17947 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPI1P17947 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPI1P17947 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPI1P17947 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPI1P17947 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPI1P17947 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPI1P17947 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPI1P17947 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPI1P17947 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPI1P17947 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPI1P17947 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPI1P17947 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPI1P17947 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPI1P17947 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms