Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB2P17787 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms