Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAP43P17677 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAP43P17677 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAP43P17677 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAP43P17677 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAP43P17677 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAP43P17677 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAP43P17677 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GAP43P17677 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GAP43P17677 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GAP43P17677 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAP43P17677 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GAP43P17677 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAP43P17677 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAP43P17677 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAP43P17677 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAP43P17677 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAP43P17677 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAP43P17677 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAP43P17677 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAP43P17677 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAP43P17677 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAP43P17677 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAP43P17677 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAP43P17677 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAP43P17677 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAP43P17677 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAP43P17677 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAP43P17677 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAP43P17677 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAP43P17677 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAP43P17677 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAP43P17677 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAP43P17677 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAP43P17677 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAP43P17677 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAP43P17677 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAP43P17677 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAP43P17677 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GAP43P17677 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAP43P17677 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAP43P17677 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAP43P17677 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAP43P17677 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAP43P17677 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAP43P17677 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAP43P17677 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAP43P17677 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAP43P17677 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAP43P17677 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAP43P17677 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAP43P17677 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAP43P17677 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GAP43P17677 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GAP43P17677 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GAP43P17677 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GAP43P17677 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GAP43P17677 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GAP43P17677 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GAP43P17677 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GAP43P17677 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GAP43P17677 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GAP43P17677 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GAP43P17677 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GAP43P17677 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GAP43P17677 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GAP43P17677 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GAP43P17677 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GAP43P17677 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAP43P17677 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAP43P17677 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAP43P17677 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAP43P17677 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GAP43P17677 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAP43P17677 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAP43P17677 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAP43P17677 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAP43P17677 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAP43P17677 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAP43P17677 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAP43P17677 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAP43P17677 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAP43P17677 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAP43P17677 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAP43P17677 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAP43P17677 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GAP43P17677 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GAP43P17677 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAP43P17677 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAP43P17677 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAP43P17677 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAP43P17677 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAP43P17677 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAP43P17677 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAP43P17677 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAP43P17677 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAP43P17677 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAP43P17677 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAP43P17677 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAP43P17677 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms