Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEBPBP17676 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms