Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA1P17302 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA1P17302 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA1P17302 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA1P17302 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA1P17302 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA1P17302 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA1P17302 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA1P17302 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA1P17302 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA1P17302 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA1P17302 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA1P17302 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA1P17302 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA1P17302 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA1P17302 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA1P17302 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA1P17302 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA1P17302 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA1P17302 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA1P17302 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA1P17302 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA1P17302 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA1P17302 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA1P17302 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA1P17302 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA1P17302 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA1P17302 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA1P17302 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA1P17302 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA1P17302 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA1P17302 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA1P17302 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA1P17302 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA1P17302 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA1P17302 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA1P17302 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJA1P17302 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJA1P17302 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA1P17302 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA1P17302 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA1P17302 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA1P17302 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA1P17302 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA1P17302 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA1P17302 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA1P17302 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA1P17302 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA1P17302 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA1P17302 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA1P17302 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA1P17302 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA1P17302 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA1P17302 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA1P17302 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA1P17302 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA1P17302 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA1P17302 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA1P17302 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA1P17302 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA1P17302 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA1P17302 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA1P17302 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA1P17302 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA1P17302 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA1P17302 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA1P17302 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA1P17302 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA1P17302 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA1P17302 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA1P17302 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA1P17302 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA1P17302 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA1P17302 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms