Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOT1P17174 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOT1P17174 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOT1P17174 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOT1P17174 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOT1P17174 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOT1P17174 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOT1P17174 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOT1P17174 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOT1P17174 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOT1P17174 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOT1P17174 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOT1P17174 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOT1P17174 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOT1P17174 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOT1P17174 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOT1P17174 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOT1P17174 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOT1P17174 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOT1P17174 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOT1P17174 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOT1P17174 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOT1P17174 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOT1P17174 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOT1P17174 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOT1P17174 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOT1P17174 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GOT1P17174 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOT1P17174 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOT1P17174 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOT1P17174 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOT1P17174 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOT1P17174 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOT1P17174 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOT1P17174 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOT1P17174 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GOT1P17174 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOT1P17174 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOT1P17174 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOT1P17174 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOT1P17174 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOT1P17174 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOT1P17174 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOT1P17174 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOT1P17174 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GOT1P17174 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOT1P17174 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GOT1P17174 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOT1P17174 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOT1P17174 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOT1P17174 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOT1P17174 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOT1P17174 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOT1P17174 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOT1P17174 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOT1P17174 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GOT1P17174 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOT1P17174 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOT1P17174 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOT1P17174 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOT1P17174 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOT1P17174 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOT1P17174 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GOT1P17174 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOT1P17174 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOT1P17174 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOT1P17174 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOT1P17174 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOT1P17174 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOT1P17174 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOT1P17174 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOT1P17174 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOT1P17174 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOT1P17174 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOT1P17174 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOT1P17174 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GOT1P17174 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOT1P17174 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOT1P17174 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOT1P17174 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOT1P17174 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOT1P17174 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOT1P17174 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOT1P17174 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOT1P17174 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOT1P17174 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms