Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF3P17036 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF3P17036 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF3P17036 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF3P17036 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF3P17036 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms