Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD44P16070 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD44P16070 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD44P16070 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD44P16070 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CD44P16070 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD44P16070 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD44P16070 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD44P16070 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CD44P16070 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD44P16070 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD44P16070 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD44P16070 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD44P16070 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD44P16070 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD44P16070 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD44P16070 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD44P16070 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD44P16070 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CD44P16070 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CD44P16070 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CD44P16070 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD44P16070 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD44P16070 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD44P16070 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD44P16070 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD44P16070 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD44P16070 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD44P16070 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD44P16070 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD44P16070 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD44P16070 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD44P16070 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD44P16070 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD44P16070 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CD44P16070 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD44P16070 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD44P16070 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD44P16070 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD44P16070 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD44P16070 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD44P16070 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD44P16070 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD44P16070 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD44P16070 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD44P16070 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD44P16070 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD44P16070 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD44P16070 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD44P16070 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD44P16070 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD44P16070 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD44P16070 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD44P16070 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD44P16070 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD44P16070 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD44P16070 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CD44P16070 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD44P16070 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CD44P16070 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD44P16070 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CD44P16070 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD44P16070 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CD44P16070 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD44P16070 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD44P16070 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD44P16070 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD44P16070 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD44P16070 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD44P16070 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD44P16070 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD44P16070 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CD44P16070 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD44P16070 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD44P16070 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD44P16070 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD44P16070 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD44P16070 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD44P16070 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD44P16070 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD44P16070 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD44P16070 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD44P16070 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD44P16070 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CD44P16070 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD44P16070 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD44P16070 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms