Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA3P15088 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA3P15088 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA3P15088 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA3P15088 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA3P15088 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA3P15088 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA3P15088 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA3P15088 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA3P15088 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA3P15088 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA3P15088 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA3P15088 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA3P15088 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA3P15088 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA3P15088 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA3P15088 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA3P15088 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA3P15088 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA3P15088 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA3P15088 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA3P15088 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA3P15088 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA3P15088 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA3P15088 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA3P15088 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA3P15088 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA3P15088 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA3P15088 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA3P15088 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA3P15088 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA3P15088 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA3P15088 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA3P15088 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA3P15088 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA3P15088 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA3P15088 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA3P15088 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA3P15088 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA3P15088 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA3P15088 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA3P15088 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA3P15088 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA3P15088 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA3P15088 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA3P15088 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA3P15088 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA3P15088 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA3P15088 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA3P15088 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA3P15088 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA3P15088 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA3P15088 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA3P15088 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA3P15088 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA3P15088 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA3P15088 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA3P15088 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA3P15088 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms