Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFAPP14136 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GFAPP14136 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFAPP14136 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFAPP14136 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFAPP14136 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFAPP14136 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GFAPP14136 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFAPP14136 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFAPP14136 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFAPP14136 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFAPP14136 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFAPP14136 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFAPP14136 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFAPP14136 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFAPP14136 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFAPP14136 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFAPP14136 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFAPP14136 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFAPP14136 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFAPP14136 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFAPP14136 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFAPP14136 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFAPP14136 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFAPP14136 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFAPP14136 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFAPP14136 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFAPP14136 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFAPP14136 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFAPP14136 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFAPP14136 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFAPP14136 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFAPP14136 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFAPP14136 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFAPP14136 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GFAPP14136 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFAPP14136 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFAPP14136 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GFAPP14136 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFAPP14136 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFAPP14136 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFAPP14136 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFAPP14136 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFAPP14136 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFAPP14136 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFAPP14136 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFAPP14136 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFAPP14136 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFAPP14136 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFAPP14136 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFAPP14136 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFAPP14136 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFAPP14136 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFAPP14136 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFAPP14136 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFAPP14136 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFAPP14136 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFAPP14136 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFAPP14136 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFAPP14136 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFAPP14136 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFAPP14136 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFAPP14136 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFAPP14136 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFAPP14136 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFAPP14136 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFAPP14136 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFAPP14136 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFAPP14136 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFAPP14136 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFAPP14136 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GFAPP14136 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFAPP14136 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFAPP14136 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms