Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms