Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD8P13378 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD8P13378 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms