Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH1P12830 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH1P12830 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH1P12830 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH1P12830 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH1P12830 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH1P12830 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH1P12830 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH1P12830 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH1P12830 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH1P12830 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH1P12830 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH1P12830 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH1P12830 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH1P12830 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH1P12830 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH1P12830 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH1P12830 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH1P12830 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH1P12830 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH1P12830 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH1P12830 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH1P12830 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH1P12830 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH1P12830 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH1P12830 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH1P12830 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH1P12830 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH1P12830 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH1P12830 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH1P12830 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH1P12830 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH1P12830 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH1P12830 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH1P12830 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH1P12830 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH1P12830 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH1P12830 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH1P12830 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH1P12830 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH1P12830 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH1P12830 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH1P12830 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH1P12830 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH1P12830 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH1P12830 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH1P12830 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH1P12830 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH1P12830 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH1P12830 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH1P12830 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH1P12830 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH1P12830 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH1P12830 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH1P12830 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms