Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms