Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2MP0CAP2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms