Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLK3P07288 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLK3P07288 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLK3P07288 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLK3P07288 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLK3P07288 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLK3P07288 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLK3P07288 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLK3P07288 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLK3P07288 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLK3P07288 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLK3P07288 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLK3P07288 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLK3P07288 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLK3P07288 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLK3P07288 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLK3P07288 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLK3P07288 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLK3P07288 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLK3P07288 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLK3P07288 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLK3P07288 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLK3P07288 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLK3P07288 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLK3P07288 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLK3P07288 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLK3P07288 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLK3P07288 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLK3P07288 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLK3P07288 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLK3P07288 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLK3P07288 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLK3P07288 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KLK3P07288 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLK3P07288 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLK3P07288 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLK3P07288 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLK3P07288 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLK3P07288 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLK3P07288 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLK3P07288 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KLK3P07288 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLK3P07288 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLK3P07288 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLK3P07288 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLK3P07288 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLK3P07288 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLK3P07288 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLK3P07288 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLK3P07288 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLK3P07288 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLK3P07288 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLK3P07288 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLK3P07288 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLK3P07288 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLK3P07288 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLK3P07288 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLK3P07288 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLK3P07288 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLK3P07288 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLK3P07288 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLK3P07288 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLK3P07288 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLK3P07288 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLK3P07288 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLK3P07288 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLK3P07288 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLK3P07288 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLK3P07288 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLK3P07288 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLK3P07288 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms