Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB1P05556 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms