Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDN1P05305 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDN1P05305 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDN1P05305 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDN1P05305 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDN1P05305 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDN1P05305 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EDN1P05305 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDN1P05305 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDN1P05305 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDN1P05305 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDN1P05305 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDN1P05305 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDN1P05305 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDN1P05305 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDN1P05305 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDN1P05305 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDN1P05305 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDN1P05305 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDN1P05305 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDN1P05305 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDN1P05305 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDN1P05305 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDN1P05305 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDN1P05305 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDN1P05305 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDN1P05305 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDN1P05305 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EDN1P05305 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDN1P05305 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDN1P05305 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDN1P05305 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDN1P05305 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDN1P05305 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDN1P05305 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDN1P05305 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDN1P05305 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDN1P05305 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDN1P05305 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDN1P05305 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDN1P05305 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDN1P05305 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDN1P05305 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDN1P05305 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDN1P05305 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDN1P05305 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDN1P05305 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDN1P05305 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDN1P05305 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDN1P05305 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDN1P05305 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDN1P05305 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EDN1P05305 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDN1P05305 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDN1P05305 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDN1P05305 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDN1P05305 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDN1P05305 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDN1P05305 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDN1P05305 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDN1P05305 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDN1P05305 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDN1P05305 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms