Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT1P04264 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT1P04264 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT1P04264 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT1P04264 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT1P04264 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT1P04264 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT1P04264 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT1P04264 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT1P04264 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT1P04264 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT1P04264 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT1P04264 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT1P04264 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT1P04264 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT1P04264 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT1P04264 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT1P04264 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT1P04264 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT1P04264 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT1P04264 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT1P04264 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT1P04264 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT1P04264 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT1P04264 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT1P04264 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT1P04264 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT1P04264 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT1P04264 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT1P04264 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT1P04264 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT1P04264 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT1P04264 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT1P04264 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT1P04264 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT1P04264 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT1P04264 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT1P04264 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT1P04264 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT1P04264 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT1P04264 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT1P04264 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT1P04264 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT1P04264 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT1P04264 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT1P04264 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT1P04264 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT1P04264 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT1P04264 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT1P04264 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT1P04264 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT1P04264 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT1P04264 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT1P04264 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT1P04264 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT1P04264 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT1P04264 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT1P04264 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT1P04264 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT1P04264 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT1P04264 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT1P04264 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT1P04264 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT1P04264 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT1P04264 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT1P04264 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT1P04264 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT1P04264 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT1P04264 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT1P04264 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT1P04264 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT1P04264 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT1P04264 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT1P04264 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT1P04264 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT1P04264 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT1P04264 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT1P04264 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT1P04264 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT1P04264 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT1P04264 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT1P04264 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT1P04264 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT1P04264 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT1P04264 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT1P04264 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT1P04264 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT1P04264 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT1P04264 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT1P04264 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT1P04264 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT1P04264 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT1P04264 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT1P04264 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT1P04264 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT1P04264 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT1P04264 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT1P04264 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT1P04264 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT1P04264 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms