Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC3P02656 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC3P02656 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC3P02656 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC3P02656 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC3P02656 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC3P02656 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC3P02656 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC3P02656 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC3P02656 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC3P02656 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC3P02656 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC3P02656 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC3P02656 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC3P02656 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC3P02656 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC3P02656 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC3P02656 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC3P02656 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC3P02656 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC3P02656 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC3P02656 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC3P02656 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC3P02656 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC3P02656 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC3P02656 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC3P02656 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC3P02656 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC3P02656 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC3P02656 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC3P02656 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC3P02656 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC3P02656 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC3P02656 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC3P02656 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC3P02656 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC3P02656 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC3P02656 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC3P02656 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC3P02656 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC3P02656 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOC3P02656 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC3P02656 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC3P02656 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC3P02656 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC3P02656 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC3P02656 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC3P02656 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC3P02656 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC3P02656 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC3P02656 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms