Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms