Protein–RNA interactions for Protein: O95967

EFEMP2, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP2O95967 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP2O95967 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP2O95967 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms