Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX58O95786 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX58O95786 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX58O95786 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX58O95786 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX58O95786 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX58O95786 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX58O95786 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX58O95786 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX58O95786 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX58O95786 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX58O95786 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX58O95786 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX58O95786 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX58O95786 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX58O95786 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX58O95786 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX58O95786 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX58O95786 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX58O95786 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX58O95786 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX58O95786 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX58O95786 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX58O95786 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX58O95786 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX58O95786 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX58O95786 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX58O95786 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX58O95786 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX58O95786 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX58O95786 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX58O95786 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX58O95786 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX58O95786 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX58O95786 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DDX58O95786 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DDX58O95786 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX58O95786 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX58O95786 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX58O95786 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX58O95786 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX58O95786 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX58O95786 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX58O95786 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX58O95786 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX58O95786 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX58O95786 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX58O95786 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX58O95786 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX58O95786 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX58O95786 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX58O95786 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX58O95786 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX58O95786 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX58O95786 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX58O95786 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX58O95786 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX58O95786 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX58O95786 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX58O95786 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX58O95786 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX58O95786 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX58O95786 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX58O95786 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX58O95786 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX58O95786 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX58O95786 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX58O95786 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX58O95786 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX58O95786 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX58O95786 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX58O95786 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX58O95786 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX58O95786 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX58O95786 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX58O95786 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX58O95786 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX58O95786 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX58O95786 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX58O95786 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX58O95786 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX58O95786 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX58O95786 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX58O95786 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX58O95786 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX58O95786 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms