Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPF6O94906 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms