Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM3O75607 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM3O75607 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM3O75607 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM3O75607 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM3O75607 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM3O75607 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM3O75607 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM3O75607 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM3O75607 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM3O75607 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM3O75607 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM3O75607 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM3O75607 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM3O75607 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM3O75607 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM3O75607 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM3O75607 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM3O75607 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM3O75607 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM3O75607 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM3O75607 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM3O75607 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM3O75607 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM3O75607 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM3O75607 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM3O75607 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM3O75607 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM3O75607 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM3O75607 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM3O75607 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM3O75607 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM3O75607 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM3O75607 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM3O75607 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM3O75607 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM3O75607 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM3O75607 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM3O75607 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM3O75607 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM3O75607 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM3O75607 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM3O75607 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM3O75607 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM3O75607 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM3O75607 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM3O75607 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPM3O75607 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPM3O75607 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPM3O75607 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM3O75607 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM3O75607 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM3O75607 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM3O75607 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM3O75607 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM3O75607 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM3O75607 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM3O75607 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM3O75607 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM3O75607 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM3O75607 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM3O75607 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM3O75607 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM3O75607 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM3O75607 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM3O75607 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM3O75607 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM3O75607 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM3O75607 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM3O75607 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM3O75607 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM3O75607 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM3O75607 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM3O75607 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM3O75607 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM3O75607 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM3O75607 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM3O75607 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM3O75607 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM3O75607 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM3O75607 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM3O75607 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM3O75607 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM3O75607 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM3O75607 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM3O75607 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM3O75607 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM3O75607 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms