Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms