Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms