Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM24O75264 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms