Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT3O75175 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNOT3O75175 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms