Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC45.93■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ABCC9O60706 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC45.87■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC45.87■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC45.87■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC45.82■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.93
ABCC9O60706 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC45.81■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC45.79■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC45.78■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC45.76■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
ABCC9O60706 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC45.75■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.74■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC45.72■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms